Trong đám học sinh lưu truyền một lời đồn đại rằng một Tử Thần mang tên Boogiepop đang ẩn náu trong thành phố. Tử Thần dung mạo cực kì thanh tú ấy sẽ tới bắt bạn đem đi khi bạn vừa tới độ tuổi đẹp nhất.Nhưng liệu đó chỉ là lời đồn đại, hay là sự thực? Boogiepop thực ra là ai và là cái gì? Boogiepop Phantom tuy có thể xem với tư cách một anime độc lập, nhưng nó kể về những việc xảy ra sau các sự kiện trong cuốn tiểu thuyết Boogiepop wa warawanai (Tiếng Anh: Boogiepop Doesn't Laugh hoặc Boogiepop and Others).
