Phim Nhạc Viện Siêu Quậy xoay quanh nhân vật Chiaki Shinichi là một sinh viên năm thứ tư khoa piano của trường Cao đẳng nhạc Momogaoka. Anh kỹ tính, tài năng, đẹp trai và luôn nuôi ước mơ được trở thành người chỉ huy dàn nhạc nhờ cảm hứng của Sebastino Vieira, một nhạc trưởng tài ba truyền lại. Vì một tai nạn lúc nhỏ, Chiaki mang chứng bệnh sợ lên máy bay và vì thế đành an phận ở lại Nhật Bản để học piano. Mọi chuyện thay đổi khi một nhạc trưởng với tên tuổi ngang tầm Vieira, Franz Stresemann, đến Nhật một cách bí ẩn và khiến Chiaki trở thành chỉ huy dàn nhạc S-oke, một dàn nhạc tụ tập những sinh viên kỳ quặc nhất trong trường. Với sự giúp đỡ của cô bạn học và cũng là cô hàng xóm lập dị, ở dơ có một không hai nhưng lại có năng khiếu piano bẩm sinh Nodame, anh chàng đam mê nhạc rock ở lại lớp vì thi trượt violông Mine Ryutaro, vĩ cầm trưởng tài năng Miki Kiyora và cậu bạn nhút nhát chơi trống Masumi, Chiaki từ từ hiểu được cách điều khiển một dàn nhạc không chỉ theo sách vở và tìm ra được tài năng chỉ huy dàn nhạc của mình. Qua đó, Nodame và Mine Ryutaro cũng khám phá ra những năng khiếu bẩm sinh của bản thân mà trước giờ tưởng như đã chìm vào quên lãng. Nodame Cantabile, đằng sau những pha gây hài hết sức vui nhộn là chuyến hành trình đi tìm lại bản thân và đam mê âm nhạc, đam mê khám phá cuộc sống
